Dans le monde des Hackers, Takagi Fujimaru, étudiant en 2nd année au lycée faisant parti du club de journalisme, est connu sous le nom de "Falcon". Fujimaru se retrouvera mêlé à une affaire qui s'est produite suite à un massacre la veille de Noël en Russie. Ce virus est appelé "Bloody Monday" . Il aurait été récupéré par une jeune femme mystérieuse nommé Maya. Falcon se servira alors de ses compétences pour pouvoir déchiffrer tous ces crimes.